Após requisição administrativa realizada pela Prefeitura de Salvador, o Hospital Especializado Salvador, localizado na Federação, passou a funcionar exclusivamente para atender a casos de Covid-19 pelo Sistema Único de Saúde (SUS) e teve sua gestão estabelecida por meio de parceria ente a Prefeitura e a Santa Casa de Misericórdia da Bahia, conforme publicação no Diário Oficial Municipal de 25 de fevereiro de 2021.
Contratada como Organização Social (OS), a Santa Casa da Bahia iniciou de imediato os trabalhos de gestão, planejamento, operacionalização e execução das ações e serviços de saúde na unidade, conforme condições estabelecidas no projeto básico para enfrentamento da pandemia de Covid-19 e mediante encaminhamento de pacientes por meio da Central de Regulação de Urgências e Complexo Regulador de Salvador.